RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000244906.6

DKFZP434K028-201, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DKFZP434K028, Length 927 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-201ENST00000244906 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KIF3BO15066 747 aa23.57■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.53■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TNRQ92752 1358 aa23.52■■□□□ 1.36
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.51■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NCOA2Q15596 1464 aa23.51■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.5■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PZPP20742 1482 aa23.49■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.49■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.48■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.47■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.45■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MIA2Q96PC5 1412 aa23.44■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.44■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HSPA1LP34931 641 aa23.43■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.43■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PIP4K2BP78356 416 aa23.42■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.42■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CPS1P31327 1500 aa23.42■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.41■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.4■■□□□ 1.34
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TSPY4P0CV99 314 aa23.39■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TSPY10P0CW01 314 aa23.39■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.39■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NLRP1Q9C000 1473 aa23.38■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TOM1O60784 492 aa23.38■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DEPDC5O75140 1603 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ALKQ9UM73 1620 aa23.37■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MED14O60244 1454 aa23.36■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IQGAP1P46940 1657 aa23.34■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ABCC3O15438 1527 aa23.33■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.33■■□□□ 1.33
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.32■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CEP152O94986 1710 aa23.32■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.3■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.28■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.28■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ERVK-7P63135 1459 aa23.27■■□□□ 1.32
DKFZP434K028-201ENST00000244906 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.25■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.25■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-201ENST00000244906 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.2■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LTKP29376 864 aa23.19■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MAP3K1Q13233 1512 aa23.18■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.18■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SYNMO15061 1565 aa23.16■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.15■■□□□ 1.3
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.14■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SLIT1O75093 1534 aa23.13■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.13■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ABCC5O15440 1437 aa23.12■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.12■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PIK3C2BO00750 1634 aa23.11■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KIF15Q9NS87 1388 aa23.11■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.09■■□□□ 1.29
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ERBINQ96RT1 1412 aa23.07■■□□□ 1.28
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EID1Q9Y6B2 187 aa23.04■■□□□ 1.28
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.03■■□□□ 1.28
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DAPK1P53355 1430 aa23.03■■□□□ 1.28
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IDI1Q13907 227 aa23.03■■□□□ 1.28
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.01■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.99■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TET3O43151 1660 aa22.99■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KANK1Q14678 1352 aa22.98■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.98■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.97■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.97■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KCNA6P17658 529 aa22.96■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.96■■□□□ 1.27
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TMEM94Q12767 1356 aa22.95■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.95■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.95■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.93■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NOS1P29475 1434 aa22.92■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 APLP2Q06481 763 aa22.92■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADGRB3O60242 1522 aa22.87■■□□□ 1.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 POTEAQ6S8J7 498 aa22.87■■□□□ 1.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NWD1Q149M9 1564 aa22.85■■□□□ 1.25
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