RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 HMMRO75330 724 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 ST18O60284 1047 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 PHF14O94880 888 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 APBB1O00213 710 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 JPH4Q96JJ6 628 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA13-201ENST00000222753 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 NFKBIBQ15653 356 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 AAMPQ13685 434 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 STK26Q9P289 416 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 KIF3BO15066 747 aa23.08■■□□□ 1.29
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HOXA13-201ENST00000222753 COG6Q9Y2V7 657 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA13-201ENST00000222753 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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HOXA13-201ENST00000222753 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.07■■□□□ 1.28
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HOXA13-201ENST00000222753 ARID3AQ99856 593 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 STK31Q9BXU1 1019 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 APAF1O14727 1248 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 IGF1RP08069 1367 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 MIA2Q96PC5 1412 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 SOX12O15370 315 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA13-201ENST00000222753 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 TPM4P67936 248 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.98■■□□□ 1.27
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HOXA13-201ENST00000222753 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 MRE11P49959 708 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA13-201ENST00000222753 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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HOXA13-201ENST00000222753 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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HOXA13-201ENST00000222753 KIF16BQ96L93 1317 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 STAC3Q96MF2 364 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 ARAP1Q96P48 1450 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 REC8O95072 547 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 BACH2Q9BYV9 841 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXA13-201ENST00000222753 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 NUCB2P80303 420 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 PTPRGP23470 1445 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXA13-201ENST00000222753 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.89■■□□□ 1.25
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HOXA13-201ENST00000222753 KIF3AQ9Y496 699 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 RUNDC1Q96C34 613 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 NCOA2Q15596 1464 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA13-201ENST00000222753 AKNAQ7Z591 1439 aa22.83■■□□□ 1.25
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HOXA13-201ENST00000222753 EVC2Q86UK5 1308 aa22.83■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 MAP7D2Q96T17 732 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 NCAPD3P42695 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
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HOXA13-201ENST00000222753 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 IL27Q8NEV9 243 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA13-201ENST00000222753 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.8■■□□□ 1.24
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