RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.83■■□□□ 1.73
USP18-201ENST00000215794 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.83■■□□□ 1.73
USP18-201ENST00000215794 ABCA6Q8N139 1617 aa25.81■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.8■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.78■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 PZPP20742 1482 aa25.77■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.77■■□□□ 1.72
USP18-201ENST00000215794 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.75■■□□□ 1.71
USP18-201ENST00000215794 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.74■■□□□ 1.71
USP18-201ENST00000215794 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.74■■□□□ 1.71
USP18-201ENST00000215794 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.714e-6■■■■□ 19.8
USP18-201ENST00000215794 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.71■■□□□ 1.71
USP18-201ENST00000215794 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
USP18-201ENST00000215794 A2MP01023 1474 aa25.7■■□□□ 1.71
USP18-201ENST00000215794 ERBINQ96RT1 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
USP18-201ENST00000215794 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
USP18-201ENST00000215794 KIF3BO15066 747 aa25.69■■□□□ 1.7
USP18-201ENST00000215794 NUP155O75694 1391 aa25.66■■□□□ 1.7
USP18-201ENST00000215794 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.63■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.61■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 MYT1Q01538 1121 aa25.6■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 ATP10AO60312 1499 aa25.6■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 UNC13BO14795 1591 aa25.6■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 PKD2Q13563 968 aa25.6■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 GGT6Q6P531 493 aa25.6■■□□□ 1.69
USP18-201ENST00000215794 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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USP18-201ENST00000215794 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.57■■□□□ 1.68
USP18-201ENST00000215794 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.56■■□□□ 1.68
USP18-201ENST00000215794 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.55■■□□□ 1.68
USP18-201ENST00000215794 DEPDC5O75140 1603 aa25.54■■□□□ 1.68
USP18-201ENST00000215794 MLECQ14165 292 aa25.54■■□□□ 1.68
USP18-201ENST00000215794 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.52■■□□□ 1.68
USP18-201ENST00000215794 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.5■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.47■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 CEP152O94986 1710 aa25.47■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.46■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 REREQ9P2R6 1566 aa25.46■■□□□ 1.67
USP18-201ENST00000215794 ANP32CO43423 234 aa25.45■■□□□ 1.66
USP18-201ENST00000215794 KANK1Q14678 1352 aa25.44■■□□□ 1.66
USP18-201ENST00000215794 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.43■■□□□ 1.66
USP18-201ENST00000215794 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.42■■□□□ 1.66
USP18-201ENST00000215794 AGLP35573 1532 aa25.4■■□□□ 1.66
USP18-201ENST00000215794 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
USP18-201ENST00000215794 E9PCH4 1651 aa25.39■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 ABCC3O15438 1527 aa25.38■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 TET3O43151 1660 aa25.36■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.36■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 CCER2I3L3R5 266 aa25.35■■□□□ 1.65
USP18-201ENST00000215794 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.32■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 CCDC7Q96M83 1385 aa25.31■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.31■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 PLA2R1Q13018 1463 aa25.31■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.3■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 NPATQ14207 1427 aa25.29■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.28■■□□□ 1.64
USP18-201ENST00000215794 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.26■■□□□ 1.63
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USP18-201ENST00000215794 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.25■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.25■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.24■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 USP47Q96K76 1375 aa25.24■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.24■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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USP18-201ENST00000215794 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.21■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.2■■□□□ 1.63
USP18-201ENST00000215794 PTPRTO14522 1441 aa25.17■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.17■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 CLTCL1P53675 1640 aa25.17■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 TRPM2O94759 1503 aa25.17■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 ZMYM3Q14202 1370 aa25.16■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.16■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 RGL3Q3MIN7 710 aa25.15■■□□□ 1.62
USP18-201ENST00000215794 MADDQ8WXG6 1647 aa25.14■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.13■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.13■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.13■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 SYNMO15061 1565 aa25.13■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 NOS1P29475 1434 aa25.1■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 ERVK-7P63135 1459 aa25.09■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
USP18-201ENST00000215794 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.08■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.07■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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