RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.13■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 REREQ9P2R6 1566 aa23.12■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.11■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.1■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 NUP155O75694 1391 aa23.09■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.08■■□□□ 1.29
TMED1-201ENST00000214869 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.07■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.07■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 ATP10AO60312 1499 aa23.07■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.07■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.07■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 AGLP35573 1532 aa23.02■■□□□ 1.28
TMED1-201ENST00000214869 KIF3BO15066 747 aa23■■□□□ 1.27
TMED1-201ENST00000214869 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.99■■□□□ 1.27
TMED1-201ENST00000214869 TET3O43151 1660 aa22.98■■□□□ 1.27
TMED1-201ENST00000214869 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.98■■□□□ 1.27
TMED1-201ENST00000214869 KANK1Q14678 1352 aa22.98■■□□□ 1.27
TMED1-201ENST00000214869 PKD2Q13563 968 aa22.96■■□□□ 1.27
TMED1-201ENST00000214869 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.93■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 E9PCH4 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 CEP152O94986 1710 aa22.91■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 FOXD1Q16676 465 aa22.89■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.89■■□□□ 1.26
TMED1-201ENST00000214869 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.89■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 ABCC3O15438 1527 aa22.88■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.86■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 PLA2R1Q13018 1463 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.84■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 PTPRTO14522 1441 aa22.83■■□□□ 1.25
TMED1-201ENST00000214869 GGT6Q6P531 493 aa22.82■■□□□ 1.24
TMED1-201ENST00000214869 NEUROD1Q13562 356 aa22.82■■□□□ 1.24
TMED1-201ENST00000214869 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.81■■□□□ 1.24
TMED1-201ENST00000214869 TRPM2O94759 1503 aa22.8■■□□□ 1.24
TMED1-201ENST00000214869 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.78■■□□□ 1.24
TMED1-201ENST00000214869 TONSLQ96HA7 1378 aa22.76■■□□□ 1.23
TMED1-201ENST00000214869 NPATQ14207 1427 aa22.75■■□□□ 1.23
TMED1-201ENST00000214869 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.74■■□□□ 1.23
TMED1-201ENST00000214869 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TMED1-201ENST00000214869 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.71■■□□□ 1.23
TMED1-201ENST00000214869 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 CLTCL1P53675 1640 aa22.7■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 NOS1P29475 1434 aa22.7■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.7■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 MROH2AA6NES4 1674 aa22.68■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.68■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.66■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.65■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 PIK3C2BO00750 1634 aa22.65■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 KIF1BO60333 1816 aa22.65■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.64■■□□□ 1.22
TMED1-201ENST00000214869 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 SYNMO15061 1565 aa22.64■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 MLECQ14165 292 aa22.6■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.6■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 ERVK-7P63135 1459 aa22.6■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.6■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.58■■□□□ 1.21
TMED1-201ENST00000214869 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.57■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 ZMYM3Q14202 1370 aa22.57■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 ADGRB3O60242 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.55■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.54■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 STAC3Q96MF2 364 aa22.53■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 IFT172Q9UG01 1749 aa22.52■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 C3P01024 1663 aa22.52■■□□□ 1.2
TMED1-201ENST00000214869 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.48■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 MADDQ8WXG6 1647 aa22.48■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.47■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 PPLO60437 1756 aa22.46■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 IDI1Q13907 227 aa22.46■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 RGL3Q3MIN7 710 aa22.46■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.46■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.45■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.45■■□□□ 1.19
TMED1-201ENST00000214869 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.45■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 MYOM2P54296 1465 aa22.44■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.43■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.42■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 TNRQ92752 1358 aa22.42■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.4■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.4■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.39■■□□□ 1.18
TMED1-201ENST00000214869 NLRP1Q9C000 1473 aa22.38■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.38■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 LAMC1P11047 1609 aa22.37■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 ZFYVE9O95405 1425 aa22.37■■□□□ 1.17
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