RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
SLC25A3-201ENST00000188376 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.53■■■□□ 2
SLC25A3-201ENST00000188376 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.52■■■□□ 2
SLC25A3-201ENST00000188376 DEPDC5O75140 1603 aa27.52■■■□□ 2
SLC25A3-201ENST00000188376 RAPGEF3O95398 923 aa27.51■■■□□ 2
SLC25A3-201ENST00000188376 TSPOAP1O95153 1857 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF3BO15066 747 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A3-201ENST00000188376 RICTORQ6R327 1708 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC25A3-201ENST00000188376 A2MP01023 1474 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC25A3-201ENST00000188376 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCA6Q8N139 1617 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 PLA2R1Q13018 1463 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 KANK1Q14678 1352 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 E9PCH4 1651 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.39■■□□□ 1.97
SLC25A3-201ENST00000188376 TET3O43151 1660 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC25A3-201ENST00000188376 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP10AO60312 1499 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC25A3-201ENST00000188376 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC25A3-201ENST00000188376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.3■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.28■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 CEP152O94986 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 GGT6Q6P531 493 aa27.27■■□□□ 1.96
SLC25A3-201ENST00000188376 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.26■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 TRPM2O94759 1503 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 RGL3Q3MIN7 710 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPRTO14522 1441 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.23■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 MIER1Q8N108 512 aa27.23■■□□□ 1.95
SLC25A3-201ENST00000188376 CLTCL1P53675 1640 aa27.18■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC3O15438 1527 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC25A3-201ENST00000188376 NPATQ14207 1427 aa27.11■■□□□ 1.93
SLC25A3-201ENST00000188376 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.11■■□□□ 1.93
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SLC25A3-201ENST00000188376 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC25A3-201ENST00000188376 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC25A3-201ENST00000188376 USP47Q96K76 1375 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 REREQ9P2R6 1566 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.05■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF1BO60333 1816 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC25A3-201ENST00000188376 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 NEURL4Q96JN8 1562 aa27■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 AGLP35573 1532 aa27■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.99■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 MROH2AA6NES4 1674 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 MADDQ8WXG6 1647 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC25A3-201ENST00000188376 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC7Q96M83 1385 aa26.95■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 NOS1P29475 1434 aa26.95■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 STAC3Q96MF2 364 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 SYNMO15061 1565 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRB3O60242 1522 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 LAMC1P11047 1609 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 MLECQ14165 292 aa26.89■■□□□ 1.9
SLC25A3-201ENST00000188376 IFT172Q9UG01 1749 aa26.89■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 PIK3C2BO00750 1634 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 MYOM2P54296 1465 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC25A3-201ENST00000188376 ANP32CO43423 234 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 PPLO60437 1756 aa26.8■■□□□ 1.88
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