RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	MAS1	P10507	462 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	CKI1	P20485	582 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	MOB2	P43563	287 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	EOS1	P53938	366 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YPS3	Q12303	508 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	AUS1	Q08409	1394 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SUR7	P54003	302 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	API2	Q04413	109 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	MMT2	Q08970	484 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SFG1	Q12507	346 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	ZIP1	P31111	875 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	PRY2	P36110	329 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	RCK2	P38623	610 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	RBG1	P39729	369 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YNL320W	P42840	284 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	APC5	Q08683	685 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	GRR1	P24814	1151 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	DAD2	P36162	133 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	GGC1	P38988	300 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	FRT2	P39734	528 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	EFM3	P47163	339 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	NAT4	Q04751	285 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	MRX8	Q05473	314 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YPR195C	Q06594	109 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	RFM1	Q12192	310 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	MXR2	P25566	168 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	URA10	P30402	227 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	MKK1	P32490	508 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	MRPS5	P33759	307 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	NRM1	P53718	249 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SCS7	Q03529	384 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	RCF1	Q03713	159 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	CSM3	Q04659	317 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	ARR1	Q06596	294 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	STE3	P06783	470 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	HMX1	P32339	317 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	IST2	P38250	946 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	HST4	P53688	370 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YNL143C	P53908	130 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SED5	Q01590	340 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	NFI1	Q12216	726 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SKS1	Q12505	502 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	SAG1	P20840	650 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	UTR1	P21373	530 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YKL071W	P36086	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	PCH2	P38126	564 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	YHC3	P47040	408 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	ALE1	Q08548	619 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RSM27	YGR215W	HXT2	P23585	541 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	RDS1	P25611	832 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	IML3	P38265	245 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	TAE1	P38340	232 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	YCH1	P42937	148 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	HIT1	P46973	164 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	AQR1	P53943	586 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	TAF10	Q12030	206 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.58	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	RAD1	P06777	1100 aa		2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	SLX1	P38324	304 aa		2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	YIR035C	P40579	254 aa		2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	YFR018C	P43599	363 aa		2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	YDL211C	Q12121	372 aa		2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	RPN6	Q12377	434 aa		2.57	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	COX10	P21592	462 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	CIN8	P27895	1000 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	AGA2	P32781	87 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	AST1	P35183	429 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	FRM2	P37261	193 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	TRR2	P38816	342 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	BDH1	P39714	382 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	INP2	Q03824	705 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.56	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	TIP20	P33891	701 aa		2.55	□□□□□ -2
RSM27	YGR215W	MYO3	P36006	1272 aa		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.8 ms