RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SPRED2Q7Z698 418 aa24.98■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.98■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.98■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB39O15060 712 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 ZNF410Q86VK4 478 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 FIBCD1Q8N539 461 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 PPM1EQ8WY54 764 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 EPOPA6NHQ4 379 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 NLRP4Q96MN2 994 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 SAMD11Q96NU1 681 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 RGS18Q9NS28 235 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.97■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 MGEA5O60502 916 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 PTGDRQ13258 359 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 CUL4AQ13619 759 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 EMC2Q15006 297 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 TCP11Q8WWU5 503 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 TMEM143Q96AN5 459 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 MTRQ99707 1265 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 RAB34Q9BZG1 259 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.96■■□□□ 1.59
SYT6-210ENST00000641643 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 A0A087WZ62 844 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 LAD1O00515 517 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 DGKIO75912 1065 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.95■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 DGAT1O75907 488 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 GRB10Q13322 594 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 KSR1Q8IVT5 923 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 EYSQ5T1H1 3165 aa24.94■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 PDCP20941 246 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.93■■□□□ 1.58
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SYT6-210ENST00000641643 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 NACC1Q96RE7 527 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 ASAP2O43150 1006 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 MED24O75448 989 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 RPA1P27694 616 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 RARRES1P49788 294 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 EPC2Q52LR7 807 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 TMEM192Q8IY95 271 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 STK24Q9Y6E0 443 aa24.93■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 C9IYK1 514 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 FGFR4P22455 802 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 PDIA5Q14554 519 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 DSC3Q14574 896 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 DACT1Q9NYF0 836 aa24.92■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 FERMT3Q86UX7 667 aa24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CHST12Q9NRB3 414 aa24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 A0A087WWV3 80 aa24.9■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 LPXNO60711 386 aa24.9■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SYT6-210ENST00000641643 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.9■■□□□ 1.58
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