RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		29.76	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499		A0A087WZ62	844 aa		29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	RPS6KA5	O75582	802 aa		29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	BMP15	O95972	392 aa		29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	DNM2	P50570	870 aa		29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	PAK2	Q13177	524 aa		29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ARHGEF15	O94989	841 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	HYI	Q5T013	277 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	KRT79	Q5XKE5	535 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	TIFA	Q96CG3	184 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	MTR	Q99707	1265 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		29.74	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	DGAT1	O75907	488 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ARL2	P36404	184 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	NLRP7	Q8WX94	980 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	TOP1MT	Q969P6	601 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	STK24	Q9Y6E0	443 aa		29.73	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499		E9PMD0	336 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	GJB5	O95377	273 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	F13A1	P00488	732 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	AMH	P03971	560 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	FGFR4	P22455	802 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	GRB10	Q13322	594 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	DSC3	Q14574	896 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	LRRC15	Q8TF66	581 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	TTC3	P53804	2025 aa		29.72	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	GPR182	O15218	404 aa		29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	CDC42EP1	Q00587	391 aa		29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	RAB30	Q15771	203 aa		29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	PADI6	Q6TGC4	694 aa		29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF410	Q86VK4	478 aa		29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		29.71	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	LCHN	A4D1U4	455 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC39A14	Q15043	492 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	USP49	Q70CQ1	688 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	DEFB123	Q8N688	67 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	TCP11	Q8WWU5	503 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	NLRP4	Q96MN2	994 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	PLIN2	Q99541	437 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	MSRA	Q9UJ68	235 aa		29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
VEGFA-231	ENST00000640499	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	CYP11B2	P19099	503 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	GLRA2	P23416	452 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	AK8	Q96MA6	479 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM161B	Q96MY7	647 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	CSRNP2	Q9H175	543 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	EYA4	O95677	639 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	CA3	P07451	260 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	SPRED2	Q7Z698	418 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	CABP7	Q86V35	215 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	SCLT1	Q96NL6	688 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	CLIC6	Q96NY7	704 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	POLD4	Q9HCU8	107 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	RGS18	Q9NS28	235 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	COL4A6	Q14031	1691 aa		29.68	■■■□□ 2.34
VEGFA-231	ENST00000640499	CDH23	Q9H251	3354 aa		29.68	■■■□□ 2.34

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