RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHRNA4-216ENST00000636652 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.78□□□□□ -0.04
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CHRNA4-216ENST00000636652 ABHD8Q96I13 439 aa14.77□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 AKT3Q9Y243 479 aa14.77□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 H0YCG3 227 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 CAND2O75155 1236 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRNA4-216ENST00000636652 NPTX2P47972 431 aa14.76□□□□□ -0.05
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