RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 HSD17B3P37058 310 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MAPK7Q13164 816 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 EMC10Q5UCC4 262 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 H2AFVQ71UI9 128 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PACS2Q86VP3 889 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CSRNP1Q96S65 589 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STRA6Q9BX79 667 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BCS1LQ9Y276 419 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STK24Q9Y6E0 443 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FAM13AO94988 1023 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ARP10275 920 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEA9P43362 315 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STAT2P52630 851 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC174Q6PII3 467 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LMO3Q8TAP4 145 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PARVGQ9HBI0 331 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R37O75864 691 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PRELPP51888 382 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GUCY1A3Q02108 690 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PPATQ06203 517 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 AMACRQ9UHK6 382 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 INTUQ9ULD6 942 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 COG5Q9UP83 839 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SHTN1A0MZ66 631 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TISP43B9A030 160 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CYP2J2P51589 502 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PEX26Q7Z412 305 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DAAM2Q86T65 1068 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SAMM50Q9Y512 469 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ENTPD3O75355 529 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FERP16591 822 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STAT1P42224 750 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STK33Q9BYT3 514 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NPEPPSP55786 919 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DLG4P78352 724 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SEC14L1Q92503 715 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 COL4A5P29400 1685 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TTI1O43156 1089 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.52□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 KRIT1O00522 736 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 DAPK3O43293 454 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 NR1D1P20393 614 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNA5P30532 468 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CNTNAP1P78357 1384 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF844Q08AG5 666 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 TMX2Q9Y320 296 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 UBE4BO95155 1302 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CUL1Q13616 776 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 THAP2Q9H0W7 228 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 GAS7O60861 476 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM253P0C7T8 217 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ABCB4P21439 1286 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 LSP1P33241 339 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 COPB2P35606 906 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CEP55Q53EZ4 464 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 RFFLQ8WZ73 363 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 LXNQ9BS40 222 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 MYO1FO00160 1098 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 271.5 ms