RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPEPPS	P55786	919 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDC42EP1	Q00587	391 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP4A11	Q02928	519 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	DYDC2	Q96IM9	177 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029		C9IYK1	514 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP89	Q96ST8	783 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	WDR81	Q562E7	1941 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CSPG5	O95196	566 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGFR4	P22455	802 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TXK	P42681	527 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TPH2	Q8IWU9	490 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	LINC00271	P0C7V0	271 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNQ1	P51787	676 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	DSC3	Q14574	896 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	RABEP1	Q15276	862 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	C4orf19	Q8IY42	314 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A087WZ62	844 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRM6	O15303	877 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCM7	P33993	719 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF169	Q8NCN4	708 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP4	Q96MN2	994 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLVAP	Q9BX97	442 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	WNT7A	O00755	349 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ST18	O60284	1047 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGFR1	P11362	822 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	XKR9	Q5GH70	373 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	VCAN	P13611	3396 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	RFC5	P40937	340 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM189B	P81408	668 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	KSR1	Q8IVT5	923 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPME1	Q9Y570	386 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	REV3L	O60673	3130 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF410	Q86VK4	478 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM143	Q96AN5	459 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLITRK3	O94933	977 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	BMP1	P13497	986 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABI1	Q8IZP0	508 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	AAAS	Q9NRG9	546 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	DACT1	Q9NYF0	836 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB39	O15060	712 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	HOXA2	O43364	376 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNA5	P22460	613 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	P2RX5	Q93086	422 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTMR9	Q96QG7	549 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC28	Q96AY4	2481 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF174	Q15697	407 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3B-215	ENST00000621029	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		32.38	■■■□□ 2.77

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