RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.551e-7■■■□□ 15.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1B0GTH6 734 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDXKO00764 312 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF131P52739 623 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAMC2Q13753 1193 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFT74Q96LB3 600 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM206Q9H813 350 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNM1LO00429 736 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIP1RO75146 1068 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 GH1P01241 217 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLS3P13797 630 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 RFC5P40937 340 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNM2P50570 870 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 STAT5BP51692 787 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKCEQ02156 737 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 VSTM4Q8IW00 320 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 HVCN1Q96D96 273 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ESPNB1AK53 854 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 OATP04181 439 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP2R5AQ15172 486 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT31Q15323 416 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC41Q15345 812 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLG1Q92896 1179 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 HPS3Q969F9 1004 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA33Q96N06 139 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASTN1O14525 1302 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 NR1I3Q14994 352 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACCSQ96QU6 501 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 MED15Q96RN5 788 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEMA6BQ9H3T3 888 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 K7ENM7 598 aa18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEPT4O43236 478 aa18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTP1P59025 263 aa18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 SP2Q02086 613 aa18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBXN1Q04323 297 aa18.44■□□□□ 0.54
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