RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 NLRP4Q96MN2 994 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ASB2Q96Q27 587 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 LXNQ9BS40 222 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PLVAPQ9BX97 442 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TMX1Q9H3N1 280 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 RGS18Q9NS28 235 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 DACT1Q9NYF0 836 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 RGL1Q9NZL6 768 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 VAV3Q9UKW4 847 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PPME1Q9Y570 386 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 A0A087WZ62 844 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TMEM150BA6NC51 233 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ASAP2O43150 1006 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 CSPG5O95196 566 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 SKIP12755 728 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TECP42680 631 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 NPEPPSP55786 919 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ZNF174Q15697 407 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TTC38Q5R3I4 469 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ANO5Q75V66 913 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ZNF410Q86VK4 478 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 FAM228AQ86W67 206 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 NEK9Q8TD19 979 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TNFRSF25Q93038 417 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TMEM143Q96AN5 459 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 RAB34Q9BZG1 259 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 CHST12Q9NRB3 414 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PTPRSQ13332 1948 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 COL6A3P12111 3177 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 C9IYK1 514 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 NCK2O43639 380 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 MGEA5O60502 916 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 LPXNO60711 386 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ERLIN2O94905 339 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 SLITRK3O94933 977 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 STBD1O95210 358 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 EOMESO95936 686 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 OR52Z1P0C646 297 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 FGFR4P22455 802 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PHKA2P46019 1235 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TRAPPC10P48553 1259 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TFF2Q03403 129 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 DRP2Q13474 957 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TFDP1Q14186 410 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 EMC2Q15006 297 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 KSR1Q8IVT5 923 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 P2RX5Q93086 422 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TMX3Q96JJ7 454 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 KIF2CQ99661 725 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 MTRQ99707 1265 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 TTC3P53804 2025 aa6.77□□□□□ -1.32
CCL23-201ENST00000612516 A0A0U1RQF3 1178 aa6.77□□□□□ -1.33
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