RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-215ENST00000602164 TOP1MTQ969P6 601 aa29.91■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 TMEM143Q96AN5 459 aa29.91■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 NACC1Q96RE7 527 aa29.91■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.91■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa29.91■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 MGEA5O60502 916 aa29.9■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 BMP15O95972 392 aa29.9■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 CA3P07451 260 aa29.9■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 KSR1Q8IVT5 923 aa29.9■■■□□ 2.38
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USF2-215ENST00000602164 STK24Q9Y6E0 443 aa29.9■■■□□ 2.38
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USF2-215ENST00000602164 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 CDC42EP1Q00587 391 aa29.89■■■□□ 2.38
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USF2-215ENST00000602164 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
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USF2-215ENST00000602164 RHPN2Q8IUC4 686 aa29.89■■■□□ 2.38
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USF2-215ENST00000602164 CLIC4Q9Y696 253 aa29.89■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 TTC3P53804 2025 aa29.89■■■□□ 2.38
USF2-215ENST00000602164 A0A087WZ62 844 aa29.88■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 LCHNA4D1U4 455 aa29.88■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.88■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 GPR182O15218 404 aa29.88■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 ODR4Q5SWX8 454 aa29.87■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 KRT79Q5XKE5 535 aa29.87■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 ASAP3Q8TDY4 903 aa29.84■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 USP28Q96RU2 1077 aa29.84■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 ADAM2Q99965 735 aa29.84■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 CDH23Q9H251 3354 aa29.83■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 PADI6Q6TGC4 694 aa29.83■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 KCNK18Q7Z418 384 aa29.83■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 SPRED2Q7Z698 418 aa29.83■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 INSL6Q9Y581 213 aa29.83■■■□□ 2.37
USF2-215ENST00000602164 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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USF2-215ENST00000602164 ASAP2O43150 1006 aa29.82■■■□□ 2.36
USF2-215ENST00000602164 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
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USF2-215ENST00000602164 BHMT2Q9H2M3 363 aa29.82■■■□□ 2.36
USF2-215ENST00000602164 GPRC5CQ9NQ84 441 aa29.82■■■□□ 2.36
USF2-215ENST00000602164 LINC01553A4QN01 128 aa29.81■■■□□ 2.36
USF2-215ENST00000602164 E9PMD0 336 aa29.81■■■□□ 2.36
USF2-215ENST00000602164 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
USF2-215ENST00000602164 CYP11B2P19099 503 aa29.81■■■□□ 2.36
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USF2-215ENST00000602164 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
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