RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	STAT3	P40763	770 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	VSNL1	P62760	191 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP27A1	Q02318	531 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAM9	Q13443	819 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNIP1	Q15025	636 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	SFR1	Q86XK3	245 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM71B	Q8TC56	605 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LENG9	Q96B70	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	EPC1	Q9H2F5	836 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMX2	Q9Y320	296 aa		10.09	□□□□□ -0.79
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SASH3	O75995	380 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRELP	P51888	382 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GIT2	Q14161	759 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	AGER	Q15109	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC15A2	Q16348	729 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	NFIL3	Q16649	462 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSMD1	Q99460	953 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	EPHB6	O15197	1021 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GAS7	O60861	476 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GFPT2	O94808	682 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GCNT3	O95395	438 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	MOCS3	O95396	460 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	ABL1	P00519	1130 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	NR3C1	P04150	777 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALCAM	Q13740	583 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	CASP8	Q14790	479 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GJA10	Q969M2	543 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	GAN	Q9H2C0	597 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	VCPKMT	Q9H867	229 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFTUD2-222	ENST00000592408	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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