RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 HMMRO75330 724 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 BAIAP3O94812 1187 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 GJB5O95377 273 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CXCL10P02778 98 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 APPP05067 770 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 MMP3P08254 477 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ACTN1P12814 892 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 KCNA5P22460 613 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CALML3P27482 149 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RFC2P35250 354 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SOX18P35713 384 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 NOVP48745 357 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 MRE11P49959 708 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CPT1AP50416 773 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 FGD1P98174 961 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 NHLH1Q02575 133 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PLAURQ03405 335 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ARHGAP1Q07960 439 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PPP2R5BQ15173 497 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 KAT2BQ92831 832 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TNFRSF25Q93038 417 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 NAPBQ9H115 298 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RBSNQ9H1K0 784 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 IGFLR1Q9H665 355 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 COL20A1Q9P218 1284 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TSPY2A6NKD2 308 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TREHO43280 583 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SORBS3O60504 671 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 MMP20O60882 483 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 TNFRSF21O75509 655 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRM-206ENST00000578093 CKBP12277 381 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SELPP16109 830 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CES1P23141 567 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRM-206ENST00000578093 NRLP54845 237 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ERVK-21P61565 698 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PDE4BQ07343 736 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RBL2Q08999 1139 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 HYAL2Q12891 473 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 COL19A1Q14993 1142 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 PTGISQ16647 500 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 OR13H1Q8NG92 308 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 DCAF4Q8WV16 495 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 AFG1LQ8WV93 481 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRM-206ENST00000578093 SPACA7Q96KW9 195 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRM-206ENST00000578093 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 DNAJC25Q9H1X3 360 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ZFATQ9P243 1243 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 HCN2Q9UL51 889 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 FRYLO94915 3013 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRM-206ENST00000578093 KIF28PB7ZC32 967 aa4.63□□□□□ -1.67
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