RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568334.1

REXO5-215, Transcript of RNA exonuclease 5, human

TSL 3

Gene REXO5, Length 743 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO5-215	ENST00000568334	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	BTBD2	Q9BX70	525 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	POFUT1	Q9H488	388 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	KCND1	Q9NSA2	647 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		7.4	□□□□□ -1.22
REXO5-215	ENST00000568334	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CYP7B1	O75881	506 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	GLRB	P48167	497 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CTSW	P56202	376 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	MOGS	Q13724	837 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	STIL	Q15468	1287 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PHF19	Q5T6S3	580 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CEP89	Q96ST8	783 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	OR10A5	Q9H207	317 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	RFXAP	O00287	272 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	FBXO21	O94952	628 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CHGB	P05060	677 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	IL13RA1	P78552	427 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CAP1	Q01518	475 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PDCD1	Q15116	288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ACAP3	Q96P50	834 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	MYL10	Q9BUA6	226 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KCTD3	Q9Y597	815 aa		7.38	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	MIA2	Q96PC5	1412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	GABRD	O14764	452 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	RGS3	P49796	1198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	INAVA	Q3KP66	663 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	VWA3B	Q502W6	1294 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PRR31	Q5SQ13	230 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KANK2	Q63ZY3	851 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	FERMT2	Q96AC1	680 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PWWP2A	Q96N64	755 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CROT	Q9UKG9	612 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KIAA0556	O60303	1618 aa		7.37	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KNG1	P01042	644 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	HOXA5	P20719	270 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ADCY2	Q08462	1091 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	WDR48	Q8TAF3	677 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		7.36	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	NUP160	Q12769	1436 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	AKNA	Q7Z591	1439 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	APOL3	O95236	402 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	COL6A1	P12109	1028 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ZNF28	P17035	718 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	BCAR1	P56945	870 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SCAND1	P57086	179 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	CMIP	Q8IY22	773 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ORAI2	Q96SN7	254 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		7.35	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
REXO5-215	ENST00000568334	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms