RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE4BO95155 1302 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID2Q68CP9 1835 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNA14O95837 355 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 NR3C1P04150 777 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPM1P09493 284 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLK7P49862 253 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP1Q07960 439 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRF5Q13568 498 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMC2Q13753 1193 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB115Q30KQ5 88 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTERF2Q49AM1 385 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 STRA6Q9BX79 667 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 AZI2Q9H6S1 392 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 CREBZFQ9NS37 354 aa19.6■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 EMSYQ7Z589 1322 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 PEX3P56589 373 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACVR2BQ13705 512 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM139Q8IV31 216 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCPH1Q8NEM0 835 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOCS4Q8WXH5 440 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRBP2Q9NSY0 501 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJD2Q9UKL4 321 aa19.59■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFAP3LO75121 409 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R37O75864 691 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 GH1P01241 217 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYCP3Q8IZU3 236 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIFAP3Q92845 792 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM167AQ96KS9 214 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf75Q9HAS0 396 aa19.58■□□□□ 0.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC16A4O15374 487 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL13P26373 211 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGS2P41220 211 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALCAMQ13740 583 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM14Q14142 442 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAPNS2Q96L46 248 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 PANX2Q96RD6 677 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP89Q96ST8 783 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPME1Q9Y570 386 aa19.58■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC169A6NNP5 214 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP27XA6NNY8 438 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASP4P49662 377 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC26A2P50443 739 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 MARSP56192 900 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTP1P59025 263 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 OLFML2BQ68BL8 750 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAUS6Q7Z4H7 955 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNGA4Q8IV77 575 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM59Q8IWR1 403 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 BSNDQ8WZ55 320 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLG1Q92896 1179 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERGIC2Q96RQ1 377 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 GBP3Q9H0R5 595 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa19.57■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC26A0AVF1 554 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 AOC2O75106 756 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 APLP1P51693 650 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 HS2ST1Q7LGA3 356 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPTC7Q8NI37 304 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 APBA2Q99767 749 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 FLRT1Q9NZU1 646 aa19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP3O75969 853 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHA2P01877 340 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTGFP29279 349 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT9P35527 623 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFC5P40937 340 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCKAP1LP55160 1127 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACCSQ96QU6 501 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIFC3Q9BVG8 833 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOCK3Q8IZD9 2030 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 STX10O60499 249 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMPD1P17405 629 aa19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPTX2P47972 431 aa19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms