RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 WNT7AO00755 349 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 RB1P06400 928 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CYP4A11Q02928 519 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 AAK1Q2M2I8 961 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 HLA-CQ95604 372 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CEP170P1Q96L14 293 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 C9IYK1 514 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 LINC00271P0C7V0 271 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 NPEPPSP55786 919 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CDC42EP1Q00587 391 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 DSC3Q14574 896 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 C4orf19Q8IY42 314 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 REV3LO60673 3130 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ST18O60284 1047 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 FGFR4P22455 802 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 MCM7P33993 719 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TXKP42681 527 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TPH2Q8IWU9 490 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 A0A087WZ62 844 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 CSPG5O95196 566 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 XKR9Q5GH70 373 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF410Q86VK4 478 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 NLRP4Q96MN2 994 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 PLVAPQ9BX97 442 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 PPME1Q9Y570 386 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 GRM6O15303 877 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 RFC5P40937 340 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 KCNQ1P51787 676 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 KSR1Q8IVT5 923 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NEDD1-209ENST00000557092 SLITRK3O94933 977 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 FGFR1P11362 822 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 FAM189BP81408 668 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 RNF169Q8NCN4 708 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 NEK9Q8TD19 979 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM143Q96AN5 459 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 MTMR9Q96QG7 549 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 ARID2Q68CP9 1835 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 POTEMA6NI47 508 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 ZBTB39O15060 712 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 HOXA2O43364 376 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 EMC2Q15006 297 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF174Q15697 407 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 P2RX5Q93086 422 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 DACT1Q9NYF0 836 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 VCANP13611 3396 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD1-209ENST00000557092 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms