RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	FGFR1	P11362	822 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	IFNGR1	P15260	489 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GCKR	Q14397	625 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CCDC93	Q567U6	631 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	LINS1	Q8NG48	757 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	JDP2	Q8WYK2	163 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNN1	Q92952	543 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ABCC4	O15439	1325 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	HRK	O00198	91 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	MSL3P1	P0C860	447 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SDHB	P21912	280 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GYS2	P54840	703 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	MVK	Q03426	396 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CYP4F3	Q08477	520 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GRB10	Q13322	594 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GRAP	Q13588	217 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	BEND3	Q5T5X7	828 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ADGRF1	Q5T601	910 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	NSMF	Q6X4W1	530 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CDC6	Q99741	560 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	IER2	Q9BTL4	223 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	PTPRC	P08575	1304 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	OR14I1	A6ND48	311 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GRM8	O00222	908 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	NFIB	O00712	420 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	AURKA	O14965	403 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	PPIP5K2	O43314	1243 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	DLX3	O60479	287 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SEMA7A	O75326	666 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	ALDH1L1	O75891	902 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CD3E	P07766	207 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM253	P0C7T8	217 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	PRKCA	P17252	672 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNJ4	P48050	445 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GFRA1	P56159	465 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CTSW	P56202	376 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	DLG4	P78352	724 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	AMPD2	Q01433	879 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	POU4F1	Q01851	419 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TCEA2	Q15560	299 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CRY2	Q49AN0	593 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	FEZ1	Q99689	392 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	GREM2	Q9H772	168 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-222	ENST00000553570	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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