RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 INPP5AQ14642 412 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 POSTNQ15063 836 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TAF5Q15542 800 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 STYK1Q6J9G0 422 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 USP45Q70EL2 814 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 WNT8BQ93098 351 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TP53INP1Q96A56 240 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ABCG4Q9H172 646 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TOMM22Q9NS69 142 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GGA3Q9NZ52 723 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 C9orf172C9J069 976 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 H7C0S8 307 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 AHCYL1O43865 530 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CLEC3AO75596 197 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 FGF18O76093 207 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 STMN1P16949 149 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DESP17661 470 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PDCP20941 246 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CDC16Q13042 620 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MTA1Q13330 715 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MBTPS1Q14703 1052 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PLCL1Q15111 1095 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GRIK4Q16099 956 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PGS1Q32NB8 556 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZACNQ401N2 412 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GGT6Q6P531 493 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KRT74Q7RTS7 529 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PDZD3Q86UT5 571 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CMIPQ8IY22 773 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TMEM192Q8IY95 271 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCDC191Q8NCU4 936 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MGARPQ8TDB4 240 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SSH3Q8TE77 659 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ASB12Q8WXK4 309 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MAGEH1Q9H213 219 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DEF6Q9H4E7 631 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 MTRRQ9UBK8 725 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-232ENST00000552331 ASXL2Q76L83 1435 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms