RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 D2HGDHQ8N465 521 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 CSRNP2Q9H175 543 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 TRAF5O00463 557 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 PEX11BO96011 259 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC6A3Q01959 620 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 A0A1W2PRX2 142 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 H7C1D1 291 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 FLT3P36888 993 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 RGS3P49796 1198 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 BCAR1P56945 870 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 TGFB2P61812 414 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 ADCY1Q08828 1119 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SQSTM1Q13501 440 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 FHL2Q14192 279 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF174Q15697 407 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 TMPRSS6Q8IU80 811 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 MENTQ9BUN1 341 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-208ENST00000550718 CAPN14A8MX76 684 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MAFGO15525 162 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 OPA1O60313 960 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 C1SP09871 688 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TUBA3CQ13748 450 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP72Q9P209 647 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 C2orf78A6NCI8 922 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 CBX4O00257 560 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 KRT37O76014 449 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAM8P78325 824 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 DPTQ07507 201 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MIEF2Q96C03 454 aa7.26□□□□□ -1.25
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GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM260Q9NX78 707 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ANTXR2P58335 489 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 DGCR2P98153 550 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TCIRG1Q13488 830 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 CLEC14AQ86T13 490 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 KIF18BQ86Y91 864 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 WDR92Q96MX6 357 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 GPHA2Q96T91 129 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 BPIFB4P59827 614 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF460Q14592 562 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 DYDC2Q96IM9 177 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 MAKP20794 623 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-208ENST00000550718 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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