RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 OPTNQ96CV9 577 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 TADA3O75528 432 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 STXBP2Q15833 593 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 DRC1Q96MC2 740 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 STBD1O95210 358 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 WDR78Q5VTH9 848 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 UBXN4Q92575 508 aa22.93■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 DMAC2Q9NW81 257 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.93■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 TEX35Q5T0J7 233 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 IQCDQ96DY2 449 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 KRT86O43790 486 aa22.92■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 PPATQ06203 517 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 KIF5AQ12840 1032 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 CHST13Q8NET6 341 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SIX2Q9NPC8 291 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 NPTX2P47972 431 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 PRKCEQ02156 737 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SPAG5Q96R06 1193 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 POTEB2H3BUK9 544 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 PSAPP07602 524 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 NF2P35240 595 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 MAGEA1P43355 309 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 GPR162Q16538 588 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 GNPTABQ3T906 1256 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 MTERF2Q49AM1 385 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 OTOFQ9HC10 1997 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 A0A087X0T9 212 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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PRDM4-205ENST00000550376 ATP4AP20648 1035 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ACCSQ96QU6 501 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 PFASO15067 1338 aa22.89■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.89■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 SERPING1P05155 500 aa22.89■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 SAAL1Q96ER3 474 aa22.89■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.88■■□□□ 1.25
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PRDM4-205ENST00000550376 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.88■■□□□ 1.25
PRDM4-205ENST00000550376 DENND3A2RUS2 1198 aa22.88■■□□□ 1.25
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