RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550352.1

GNPTAB-207, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 787 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-207ENST00000550352 CNR2P34972 360 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 EVA1CP58658 441 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 DGKDQ16760 1214 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 FBLN7Q53RD9 439 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 CMIPQ8IY22 773 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 LGI4Q8N135 537 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A0A6YYJ9 748 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 OPHN1O60890 802 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 PCOLCEQ15113 449 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 MYPNQ86TC9 1320 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 PFKMP08237 780 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 MRE11P49959 708 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 MEOX1P50221 254 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 ZNF827Q17R98 1081 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 CT83Q5H943 113 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 DYDC2Q96IM9 177 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 DNAI1Q9UI46 699 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 SCAND1P57086 179 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 TBR1Q16650 682 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 AGBL4Q5VU57 503 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 C20orf173Q96LM9 149 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 USP18Q9UMW8 372 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 MAFGO15525 162 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 LPLP06858 475 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 CELA3BP08861 270 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 GUCY2FP51841 1108 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 FAPQ12884 760 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 ADAM15Q13444 863 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 RNF151Q2KHN1 245 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 UBXN11Q5T124 520 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 CNTD1Q8N815 330 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 SOX7Q9BT81 388 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 ERVK-21P61565 698 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PPP2CBP62714 309 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PPP2CAP67775 309 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 UGT8Q16880 541 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 USP30Q70CQ3 517 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 WDR92Q96MX6 357 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 TEPSINQ96N21 525 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 ACAP3Q96P50 834 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PTPN18Q99952 460 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 OR10A2Q9H208 303 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-207ENST00000550352 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
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