RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	HSPH1	Q92598	858 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CDKL2	Q92772	493 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ENC1	O14682	589 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	MYL4	P12829	197 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ASPH	Q12797	758 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TLK2	Q86UE8	772 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57	2e-6	■■■■□ 21.7
MARF1-205	ENST00000548025	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PRKCB	P05771	671 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ERVK-24	P63145	666 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025		M0QYT0	321 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	UBASH3A	P57075	661 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ADCY1	Q08828	1119 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PML	P29590	882 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	FOSL2	P15408	326 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SLC11A2	P49281	568 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	UBE2H	P62256	183 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	NR3C2	P08235	984 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CHML	P26374	656 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	FAM193A	P78312	1265 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	RBP5	P82980	135 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LRRC32	Q14392	662 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025		A8MXQ7	604 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	INPP4B	O15327	924 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ALPPL2	P10696	532 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	RFC2	P35250	354 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ELF2	Q15723	593 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	AP1B1	Q10567	949 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SGCG	Q13326	291 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SLC2A3	P11169	496 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CUL1	Q13616	776 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	MFSD10	Q14728	455 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CLGN	O14967	610 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	LRMP	Q12912	555 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	GPR25	O00155	361 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SUN1	O94901	812 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PRDX5	P30044	214 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	PDE1B	Q01064	536 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SATB1	Q01826	763 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	RPS6KA2	Q15349	733 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.47	□□□□□ -0.57
MARF1-205	ENST00000548025	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.47	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms