RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF3Q9NR81 526 aa26.93■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 STAT5BP51692 787 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 GRM4Q14833 912 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SEC23AQ15436 765 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 IRAK3Q9Y616 596 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 COL4A3Q01955 1670 aa26.92■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 CTSAP10619 480 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 NT5C2P49902 561 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PPM1JQ5JR12 505 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PJA1Q8NG27 643 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.91■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SPTLC1O15269 473 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 TGM1P22735 817 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PTPN14Q15678 1187 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PKD1L2Q7Z442 2459 aa26.9■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 FASNP49327 2511 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 ACTR2P61160 394 aa26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 MYADMQ96S97 322 aa26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 PARD6AQ9NPB6 346 aa26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PRDM4-202ENST00000547188 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 VTNP04004 478 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 GIT2Q14161 759 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 ATRIPQ8WXE1 791 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 KRT23Q9C075 422 aa26.88■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 KLRC2P26717 231 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 CLCN4P51793 760 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.87■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 PIK3CDO00329 1044 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 LAMTOR5O43504 91 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 GPR32O75388 356 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 MYBP10242 640 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 WTAPQ15007 396 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 IGSF21Q96ID5 467 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 KLHL5Q96PQ7 755 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 JADE2Q9NQC1 790 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.86■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 SENP2Q9HC62 589 aa26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 HBP1O60381 514 aa26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.84■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 KCNA4P22459 653 aa26.83■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 EPC1Q9H2F5 836 aa26.83■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 CLUHO75153 1309 aa26.83■■□□□ 1.89
PRDM4-202ENST00000547188 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 PDE1AP54750 535 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 STARD6P59095 220 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 ACAP1Q15027 740 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 UBE2SQ16763 222 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 METTL13Q8N6R0 699 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 NXPE3Q969Y0 559 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 BCO2Q9BYV7 579 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 MAN1C1Q9NR34 630 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa26.82■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 MAFGO15525 162 aa26.81■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 DMWDQ09019 674 aa26.81■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 ZBTB44Q8NCP5 570 aa26.81■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 STAMQ92783 540 aa26.81■■□□□ 1.88
PRDM4-202ENST00000547188 RILPL2Q969X0 211 aa26.81■■□□□ 1.88
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