RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 CDC42EP1Q00587 391 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 EMC2Q15006 297 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 IL17AQ16552 155 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 TMEM143Q96AN5 459 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 SCLT1Q96NL6 688 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 CERS4Q9HA82 394 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 COL6A3P12111 3177 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 LINC01553A4QN01 128 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 FOSL2P15408 326 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 RARRES1P49788 294 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 PDIA5Q14554 519 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 KSR1Q8IVT5 923 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 YME1L1Q96TA2 773 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.1■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 A0A087WZ62 844 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 SYT1P21579 422 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 POTEGQ6S5H5 508 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 BRAPQ7Z569 592 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 FERMT3Q86UX7 667 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF410Q86VK4 478 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 ADAM2Q99965 735 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 COL4A6Q14031 1691 aa25.09■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 EPOPA6NHQ4 379 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 ADGRE1Q14246 886 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 DSC3Q14574 896 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 ARNTL2Q8WYA1 636 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 NLRP4Q96MN2 994 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 NACC1Q96RE7 527 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 MTRQ99707 1265 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 RAB34Q9BZG1 259 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 RGS18Q9NS28 235 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 TTC3P53804 2025 aa25.08■■□□□ 1.61
CCDC189-211ENST00000545825 DENND3A2RUS2 1198 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 DGAT1O75907 488 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 FGFR4P22455 802 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 HSCBQ8IWL3 235 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 TCP11Q8WWU5 503 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 C9IYK1 514 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 DGKIO75912 1065 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 MUTP22033 750 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ERVK-21P61565 698 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ECM1Q16610 540 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.06■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 PP2D1A8MPX8 630 aa25.05■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 RFXAPO00287 272 aa25.05■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.05■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.05■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 STAG3L1P0CL83 205 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 RESTQ13127 1097 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 MTMR6Q9Y217 621 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 STK24Q9Y6E0 443 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ASAP2O43150 1006 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 CDC25AP30304 524 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ARL2P36404 184 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 FAM189BP81408 668 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 EYSQ5T1H1 3165 aa25.03■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.02■■□□□ 1.6
CCDC189-211ENST00000545825 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms