RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 MMP3P08254 477 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 TPM1P09493 284 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGAP1Q07960 439 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 EMC2Q15006 297 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 HYIQ5T013 277 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 USP37Q86T82 979 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 ACCSQ96QU6 501 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 CYP2C9P11712 490 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 INSRRP14616 1297 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PHKA2P46019 1235 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PEX3P56589 373 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SP2Q02086 613 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SPAG1Q07617 926 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PAK1Q13153 545 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM50Q86XT4 487 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 USP6NLQ92738 828 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SFI1A8K8P3 1242 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CETN3O15182 167 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CBFA2T2O43439 604 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 KRT13P13646 458 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 RARRES1P49788 294 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 STX17P56962 302 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PSMC6P62333 389 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 COASYQ13057 564 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 KCNB1Q14721 858 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 NLRP4Q96MN2 994 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 DEFB118Q96PH6 123 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 K7ERI5 159 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 ERLIN2O94905 339 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CYBAP13498 195 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 LIG4P49917 911 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PLCB4Q15147 1175 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 GRIK4Q16099 956 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 NELFBQ8WX92 580 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM143Q96AN5 459 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 EMSYQ7Z589 1322 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PLS3P13797 630 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 SCP2P22307 547 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 GUCY2CP25092 1073 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 ZNF445P59923 1031 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 MYL5Q02045 173 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 DPYDQ12882 1025 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRO-210ENST00000544244 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 FGD4Q96M96 766 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 REEP2Q9BRK0 252 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM5Q9C035 493 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRO-210ENST00000544244 FOXN1O15353 648 aa6.24□□□□□ -1.41
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