RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541005.1

LTBR-208, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 2

Gene LTBR, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-208ENST00000541005 TECP42680 631 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 EMC2Q15006 297 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 BRAPQ7Z569 592 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ERMNQ8TAM6 284 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 COL6A3P12111 3177 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 LINC01553A4QN01 128 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ZBTB39O15060 712 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 MED24O75448 989 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RARRES1P49788 294 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PDIA5Q14554 519 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 DSC3Q14574 896 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 XKR9Q5GH70 373 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 MYLIPQ8WY64 445 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RAB34Q9BZG1 259 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 STK24Q9Y6E0 443 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 MGEA5O60502 916 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 DGAT1O75907 488 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 TCP11Q8WWU5 503 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 NLRP7Q8WX94 980 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 YME1L1Q96TA2 773 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 MTRQ99707 1265 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RGS18Q9NS28 235 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 C9IYK1 514 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 BMP15O95972 392 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 FOSL2P15408 326 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SYT1P21579 422 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ERVK-21P61565 698 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 IL17AQ16552 155 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 POTEGQ6S5H5 508 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 FERMT3Q86UX7 667 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 HSCBQ8IWL3 235 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SCLT1Q96NL6 688 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 NACC1Q96RE7 527 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 A0A087WZ62 844 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 EPOPA6NHQ4 379 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ASAP2O43150 1006 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 DGKIO75912 1065 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 UPP2O95045 317 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 STAG3L1P0CL83 205 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 TMEM143Q96AN5 459 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 NLRP4Q96MN2 994 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SAMD11Q96NU1 681 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ADAM2Q99965 735 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 DENND3A2RUS2 1198 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 LINC00271P0C7V0 271 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ARL2P36404 184 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 FAM189BP81408 668 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 POU5F1BQ06416 359 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 RESTQ13127 1097 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ADGRE1Q14246 886 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 ECM1Q16610 540 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 SPRED2Q7Z698 418 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBR-208ENST00000541005 KSR1Q8IVT5 923 aa14.59□□□□□ -0.07
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