RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP112Q8N8E3 955 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ARID3AQ99856 593 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 DEF6Q9H4E7 631 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM150BA6NC51 233 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 VAV2P52735 878 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GUCY2CP25092 1073 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SP4Q02446 784 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF5AQ12840 1032 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 C4orf19Q8IY42 314 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RDM1Q8NG50 284 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE4BO95155 1302 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ARID2Q68CP9 1835 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL4O94818 638 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF11P52732 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNA1P78396 465 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP27A1Q02318 531 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RGMBQ6NW40 437 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA1Q92805 767 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 AKR1B10O60218 316 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 LCA5LO95447 670 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTR2P61160 394 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMC5P62195 406 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF862O60290 1169 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 AKAP3O75969 853 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 STBD1O95210 358 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RARRES1P49788 294 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA1Q09470 495 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 NFIL3Q16649 462 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 MORC4Q8TE76 937 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TFR2Q9UP52 801 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RCCD1A6NED2 376 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF3CO14782 793 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF263O14978 683 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TGFB1I1O43294 461 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ARIH2O95376 493 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP4BP1P59074 171 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBB4BP68371 445 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ODR4Q5SWX8 454 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX35Q5T0J7 233 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 RABGGTAQ92696 567 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ADORA2AP29274 412 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK7Q13164 816 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 PADI6Q6TGC4 694 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 DAW1Q8N136 415 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 FIZ1Q96SL8 496 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO6Q9UM54 1294 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-211ENST00000539589 CLIC2O15247 247 aa22.16■■□□□ 1.14
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