RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 RAD17O75943 681 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 IFNAR1P17181 557 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 ETFBP38117 255 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 VSNL1P62760 191 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 SQSTM1Q13501 440 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 SCARF1Q14162 830 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 NAPBQ9H115 298 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 SEPT3Q9UH03 358 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 MYO6Q9UM54 1294 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 LAMB1P07942 1786 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 DEXIO95424 95 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 LIFRP42702 1097 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 SPAG1Q07617 926 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 PLCB4Q15147 1175 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 XRRA1Q6P2D8 792 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 PI16Q6UXB8 463 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 UIMC1Q96RL1 719 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 KRT23Q9C075 422 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 LY9Q9HBG7 655 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 VEZTQ9HBM0 779 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 CABP5Q9NP86 173 aa5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CKAP5-212ENST00000533413 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 APBA1Q02410 837 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 GRIN1Q05586 938 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 UBE3CQ15386 1083 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 NTRK3Q16288 839 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 TMC7Q7Z402 723 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 SLC51AQ86UW1 340 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 MICALL2Q8IY33 904 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 MYOCDQ8IZQ8 938 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 CRACR2AQ9BSW2 395 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 SENP2Q9HC62 589 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.9□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF532Q9HCE3 1301 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 FOCADQ5VW36 1801 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 C2orf81A6NN90 581 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ERLIN2O94905 339 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 FSBPO95073 299 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 BMP15O95972 392 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 KRT9P35527 623 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 MLC1Q15049 377 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 PACS1Q6VY07 963 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 CAGE1Q8TC20 777 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 TCP11Q8WWU5 503 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 SLF1Q9BQI6 1058 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 NACAP1Q9BZK3 213 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 EXOC1Q9NV70 894 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 GUCA1BQ9UMX6 200 aa5.89□□□□□ -1.47
CKAP5-212ENST00000533413 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms