RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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PTPRK-222ENST00000532751 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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PTPRK-222ENST00000532751 TMEM143Q96AN5 459 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF576Q9H609 170 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.46■■□□□ 1.51
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PTPRK-222ENST00000532751 MYOGP15173 224 aa24.45■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 FAM161BQ96MY7 647 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 RAD9AQ99638 391 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 A0A087WWV3 80 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 A0A087WZ62 844 aa24.44■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 INSL6Q9Y581 213 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 DENND3A2RUS2 1198 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 PP2D1A8MPX8 630 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 CA3P07451 260 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 AK8Q96MA6 479 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 TMX1Q9H3N1 280 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.56e-7■□□□□ 10.4
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PTPRK-222ENST00000532751 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 ECM1Q16610 540 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 KSR1Q8IVT5 923 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 CLIC4Q9Y696 253 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 TFDP1Q14186 410 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 ADAM2Q99965 735 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 DNM3Q9UQ16 869 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 SZT2Q5T011 3432 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 SLC34A2O95436 690 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 YME1L1Q96TA2 773 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 RGS18Q9NS28 235 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRK-222ENST00000532751 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC26A4O43511 780 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 MGEA5O60502 916 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 ARL2P36404 184 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 RNF149Q8NC42 400 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
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PTPRK-222ENST00000532751 EYA4O95677 639 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 CYP11B2P19099 503 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 FGFR4P22455 802 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRK-222ENST00000532751 UBA7P41226 1012 aa24.38■■□□□ 1.49
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