RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	DMD	P11532	3685 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	MAGEB2	O15479	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	FGF18	O76093	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	IFNAR1	P17181	557 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	KLRC1	P26715	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	EVC	P57679	992 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	C22orf31	O95567	290 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TMOD1	P28289	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	SFN	P31947	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	RIT2	Q99578	217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	HOXA2	O43364	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	BRD1	O95696	1058 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	USP11	P51784	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	JAK3	P52333	1124 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ERVFC1	P60507	584 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	NTRK3	Q16288	839 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	PRR16	Q569H4	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	CASP10	Q92851	521 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF292	O60281	2723 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CSRP1-213	ENST00000530120	FSCN2	O14926	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	LAG3	P18627	525 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	PHKB	Q93100	1093 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	LENG9	Q96B70	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120		C9IYK1	514 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	GAS7	O60861	476 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	OAT	P04181	439 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	ATP4A	P20648	1035 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	CLCN5	P51795	746 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAM2	Q99965	735 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CSRP1-213	ENST00000530120	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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