RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	RABGGTA	Q92696	567 aa		6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.59	□□□□□ -1.35
COPS5-208	ENST00000519057	C2orf78	A6NCI8	922 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	CYR61	O00622	381 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SLC9A1	P19634	815 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ACRV1	P26436	265 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ACAP1	Q15027	740 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	DGKD	Q16760	1214 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	LPP	Q93052	612 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	TLR9	Q9NR96	1032 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	FLT3	P36888	993 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF174	Q15697	407 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	TKFC	Q3LXA3	575 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	OXSM	Q9NWU1	459 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		6.57	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	DGCR2	P98153	550 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	KLF10	Q13118	480 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	NME9	Q86XW9	330 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		6.56	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	C1S	P09871	688 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	DSG1	Q02413	1049 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	D2HGDH	Q8N465	521 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	MTFR1L	Q9H019	292 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	F2	P00734	622 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	BPIFB4	P59827	614 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	PTH1R	Q03431	593 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	TCIRG1	Q13488	830 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	TCEA2	Q15560	299 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC14A	Q86T13	490 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	DYDC2	Q96IM9	177 aa		6.54	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PRX2	142 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	KPNA6	O60684	536 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	BCAR1	P56945	870 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ADCY1	Q08828	1119 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	USP51	Q70EK9	711 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	KIF18B	Q86Y91	864 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	NXPE1	Q8N323	547 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	WDR92	Q96MX6	357 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	MYL10	Q9BUA6	226 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	POFUT1	Q9H488	388 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	MTG2	Q9H4K7	406 aa		6.53	□□□□□ -1.36
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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