RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ADCY3O60266 1144 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CBX7O95931 251 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 F13BP05160 661 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HUNKP57058 714 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZNF445P59923 1031 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MECOMQ03112 1051 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 BECN1Q14457 450 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 KRT32Q14532 448 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FBXL6Q8N531 539 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RNF186Q9NXI6 227 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 LAMB1P07942 1786 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ESYT3A0FGR9 886 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 YDJCA8MPS7 323 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MBD4O95243 580 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 IGLV1-40P01703 118 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PSMA5P28066 241 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SQSTM1Q13501 440 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MFSD4AQ8N468 514 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MAP4K1Q92918 833 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 OSBP2Q969R2 916 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MRIQ9BWK5 157 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FANCLQ9NW38 375 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 JAG2Q9Y219 1238 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 M0R2C6 588 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SIGLEC6O43699 453 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ITGAVP06756 1048 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FAM153BP0C7A2 387 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PRDX5P30044 214 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RABEP1Q15276 862 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RGMBQ6NW40 437 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SHISA5Q8N114 240 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TEKT1Q969V4 418 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 NAPBQ9H115 298 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 AKT3Q9Y243 479 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PRR33A8MZF0 331 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ADM5C9JUS6 153 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZNF213O14771 459 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RAD17O75943 681 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FSTP19883 344 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HSPA4P34932 840 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TDO2P48775 406 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PPP2R2AP63151 447 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TNK2Q07912 1038 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TRDNQ13061 729 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ALX1Q15699 326 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 DACT2Q5SW24 774 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ARMT1Q9H993 441 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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