RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 IKBKEQ14164 716 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA32Q96LK8 384 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SCLT1Q96NL6 688 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 E9PMD0 336 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 GHRP10912 638 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TFDP1Q14186 410 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 LPIN1Q14693 890 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 KIZQ2M2Z5 673 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RHPN2Q8IUC4 686 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP7Q8WX94 980 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 EPSTI1Q96J88 318 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTS10Q9H324 1103 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 STK17AQ9UEE5 414 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 GINS2Q9Y248 185 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SIP14410 1827 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TET1Q8NFU7 2136 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR182O15218 404 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 POU5F1BQ06416 359 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SHHQ15465 462 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM143Q96AN5 459 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 VWCEQ96DN2 955 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A087WWV3 80 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS6KA5O75582 802 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ARL2P36404 184 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PAK2Q13177 524 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 DRP2Q13474 957 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 KIFAP3Q92845 792 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 OSMRQ99650 979 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNG1Q9UIX4 513 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TCHHQ07283 1943 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PLA2G4BP0C869 781 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PLCG1P19174 1290 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SPECC1Q5M775 1068 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RASIP1Q5U651 963 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RRAGBQ5VZM2 374 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 DBF4BQ8NFT6 615 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHA7Q9UN72 937 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-212ENST00000508338 DARSP14868 501 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP2R5AQ15172 486 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf50Q5SZB4 431 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNK18Q7Z418 384 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 DRC1Q96MC2 740 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PLIN2Q99541 437 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 GUCY2CP25092 1073 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PHKA2P46019 1235 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNJ6P48051 423 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 RAD54LQ92698 747 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP4Q96MN2 994 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf75Q9HAS0 396 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PADI3Q9ULW8 664 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBBXA8MT70 800 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC12A3P55017 1021 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ADALQ6DHV7 355 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 USP49Q70CQ1 688 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 IFT74Q96LB3 600 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 CUEDC2Q9H467 287 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 CDHR5Q9HBB8 845 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A087WZ62 844 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 CD52P31358 61 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP2-212ENST00000508338 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.73■■■□□ 2.35
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