RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CXCL3-202ENST00000502974 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL3-202ENST00000502974 TUFT1Q9NNX1 390 aa27.89■■■□□ 2.06
CXCL3-202ENST00000502974 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 RFC5P40937 340 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa27.88■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 A0A087WWV3 80 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 GPR182O15218 404 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PRPHP41219 470 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 ERVK-21P61565 698 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PIGOQ8TEQ8 1089 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP7Q8WX94 980 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 RAB34Q9BZG1 259 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 ANKEF1Q9NU02 776 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 TRANK1O15050 2925 aa27.87■■■□□ 2.05
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CXCL3-202ENST00000502974 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 EMC2Q15006 297 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 FAM228AQ86W67 206 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 RHPN2Q8IUC4 686 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 COL4A6Q14031 1691 aa27.86■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 RPA1P27694 616 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PDIA5Q14554 519 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 POTEGQ6S5H5 508 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 GDPD5Q8WTR4 605 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM143Q96AN5 459 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 TMX1Q9H3N1 280 aa27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 UNC80Q8N2C7 3258 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 DENND3A2RUS2 1198 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 RARRES1P49788 294 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 CDC42EP1Q00587 391 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 GRB10Q13322 594 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 IL17AQ16552 155 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 SAMD11Q96NU1 681 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 MTRQ99707 1265 aa27.84■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.84■■■□□ 2.05
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CXCL3-202ENST00000502974 A0A087WZ62 844 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 GAS2O43903 313 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 STAG3L1P0CL83 205 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 DARSP14868 501 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 KSR1Q8IVT5 923 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP4Q96MN2 994 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 NACC1Q96RE7 527 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 MTMR6Q9Y217 621 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-202ENST00000502974 STX6O43752 255 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 MGEA5O60502 916 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 RESTQ13127 1097 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 FIBCD1Q8N539 461 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 TCP11Q8WWU5 503 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 LRFN2Q9ULH4 789 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 STK24Q9Y6E0 443 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 PP2D1A8MPX8 630 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 USO1O60763 962 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 DGAT1O75907 488 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 FGFR4P22455 802 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF410Q86VK4 478 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 ADAM2Q99965 735 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.81■■■□□ 2.04
CXCL3-202ENST00000502974 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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