RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.45■■□□□ 1.67
TRDMT1-211ENST00000495022 LZTS1Q9Y250 596 aa25.45■■□□□ 1.67
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.45■■□□□ 1.67
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 UGCGQ16739 394 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 HCSTQ9UBK5 93 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 Q4G0T1 1027 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF135Q8IUD6 432 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 TBCKQ8TEA7 893 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 FSCN2O14926 492 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CHMP2AO43633 222 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMD10O75832 226 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 GPC3P51654 580 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PLCB3Q01970 1234 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CASD1Q96PB1 797 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF19AQ9NV58 838 aa25.43■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP3A7P24462 503 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVFC1P60507 584 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 DUSP6Q16828 381 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC43Q8N309 656 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 MUTYHQ9UIF7 546 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.42■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 DEXIO95424 95 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PPM1AP35813 382 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC42EP1Q00587 391 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 ABI1Q8IZP0 508 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 SCLT1Q96NL6 688 aa25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 M0R2N6 131 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 CPLX1O14810 134 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PER2O15055 1255 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 GALNT17Q6IS24 598 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 BLIDQ8IZY5 108 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 GJA10Q969M2 543 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNH6Q9H252 994 aa25.4■■□□□ 1.66
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0U1RQF3 1178 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 EOMESO95936 686 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 XKR3Q5GH77 459 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRP7Q8WX94 980 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 MBOAT7Q96N66 472 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF558Q96NG5 402 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 DACT1Q9NYF0 836 aa25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 TDP2O95551 362 aa25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP89Q96ST8 783 aa25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO10Q9HD67 2058 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT17Q04695 432 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNC3Q14003 757 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 NPY5RQ15761 445 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 MTERF2Q49AM1 385 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 SUSD6Q92537 303 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 EDAQ92838 391 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 TCF25Q9BQ70 676 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 CHST12Q9NRB3 414 aa25.37■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 STBD1O95210 358 aa25.36■■□□□ 1.65
TRDMT1-211ENST00000495022 DNM2P50570 870 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms