RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.36■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 TCP11Q8WWU5 503 aa24.36■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 NRCAMQ92823 1304 aa24.36■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 HAS3O00219 553 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEB2O15479 319 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 GCNT3O95395 438 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CCL5P13501 91 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 DNM2P50570 870 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 PEX3P56589 373 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC169A6NNP5 214 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R2P41236 205 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 SMTNP53814 917 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.35■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 BECN2A8MW95 431 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 KIF20AO95235 890 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 C22orf31O95567 290 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 TMOD1P28289 359 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 IER5Q5VY09 327 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 ADSSL1Q8N142 457 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 DEFB118Q96PH6 123 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 RBSNQ9H1K0 784 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CBX8Q9HC52 389 aa24.34■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 PSMA7O14818 248 aa24.33■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.33■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.33■■□□□ 1.49
PSPC1-204ENST00000492741 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 K7ENM7 598 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 GNAT1P11488 350 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 ARL2P36404 184 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 RTP1P59025 263 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 NELFBQ8WX92 580 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 KBTBD13C9JR72 458 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 CABYRO75952 493 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 MYBP10242 640 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 CLCN3P51790 818 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 ACLYP53396 1101 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 STX17P56962 302 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PAK1Q13153 545 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 DRP2Q13474 957 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PPP2R5AQ15172 486 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 LUZP1Q86V48 1076 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 MYH11P35749 1972 aa24.32■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 SLC16A4O15374 487 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 NPTX2P47972 431 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 CASP5P51878 434 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 BSNDQ8WZ55 320 aa24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 SMTNL1A8MU46 457 aa24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.3■■□□□ 1.48
PSPC1-204ENST00000492741 AKT3Q9Y243 479 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms