RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PRAMEF1	O95521	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP8B2	P98198	1209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	WHAMM	Q8TF30	809 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NT5C1B	Q96P26	610 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ANO3	Q9BYT9	981 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CABP5	Q9NP86	173 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CHST7	Q9NS84	486 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ASB1	Q9Y576	335 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	EEA1	Q15075	1411 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PRX	Q9BXM0	1461 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MTHFD2	P13995	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TNFSF4	P23510	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HOXD12	P35452	270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	HSPA7	P48741	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP3CA	Q08209	521 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ADAM9	Q13443	819 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	BRF1	Q92994	677 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC12A8	A0AV02	714 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163		A6NCN8	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TISP43	B9A030	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163		B9A039	149 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	LINC01387	J3KSC0	135 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	AP1G1	O43747	822 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TM4SF1	P30408	202 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	JAM2	P57087	298 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PROSER1	Q86XN7	944 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SAMD11	Q96NU1	681 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CEP170	Q5SW79	1584 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A0A6YYJ9	748 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CHL1	O00533	1208 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	LCE2B	O14633	110 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CTSS	P25774	331 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT2	P35908	639 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PDE6B	P35913	854 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	IL2	P60568	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF169	Q8NCN4	708 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	RMDN3	Q96TC7	470 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A1W2PQM1	296 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	GALNS	P34059	522 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	NR1H2	P55055	460 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	CABP4	P57796	275 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	AMPD2	Q01433	879 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SCRN1	Q12765	414 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UBXN4-208	ENST00000490163	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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