RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 FSCN2O14926 492 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 GPC3P51654 580 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ERVFC1P60507 584 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PRKCEQ02156 737 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 Q4G0T1 1027 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF135Q8IUD6 432 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 RDM1Q8NG50 284 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TBCKQ8TEA7 893 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 CASD1Q96PB1 797 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF19AQ9NV58 838 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 TECTAO75443 2155 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF318Q5VUA4 2279 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMD10O75832 226 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIOO75962 3097 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP3A7P24462 503 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 UGCGQ16739 394 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DUSP6Q16828 381 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MUTYHQ9UIF7 546 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 M0R2N6 131 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PER2O15055 1255 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CHMP2AO43633 222 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DEXIO95424 95 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CDC42EP1Q00587 391 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 B3GNT9Q6UX72 402 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MBOAT7Q96N66 472 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PIEZO1Q92508 2521 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0U1RQF3 1178 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 EOMESO95936 686 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNC3Q14003 757 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 XKR3Q5GH77 459 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 GALNT17Q6IS24 598 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ABI1Q8IZP0 508 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 BLIDQ8IZY5 108 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC43Q8N309 656 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 GJA10Q969M2 543 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CEP89Q96ST8 783 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNH6Q9H252 994 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CPLX1O14810 134 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 STBD1O95210 358 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PPM1AP35813 382 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 EDAQ92838 391 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF558Q96NG5 402 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DACT1Q9NYF0 836 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TDP2O95551 362 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 KRT17Q04695 432 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 NPY5RQ15761 445 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 NLRP7Q8WX94 980 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 SUSD6Q92537 303 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 SCLT1Q96NL6 688 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CHST12Q9NRB3 414 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 FGFR4P22455 802 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 DRP2Q13474 957 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 MTERF2Q49AM1 385 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TCF25Q9BQ70 676 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms