RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 FANCCQ00597 558 aa5.15□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.15□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 BTBD7Q9P203 1132 aa5.15□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.15□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM38O00635 465 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAN2B1O00754 1011 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 BPIFB4P59827 614 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF425Q6IV72 752 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 GIPC2Q8TF65 315 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ST8SIA2Q92186 375 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.14□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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CACNA2D1-211ENST00000486539 GNAT2P19087 354 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHDQ96IW2 340 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP26Q9BV47 211 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.13□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 LPXNO60711 386 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 MC4RP32245 332 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAM8P78325 824 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC27Q2M243 656 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF384Q8TF68 577 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARL8AQ96BM9 186 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 AMNQ9BXJ7 453 aa5.12□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAGE12BA1L429 117 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPIG6BO95866 241 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXI1Q12951 378 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAK2Q13177 524 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP53Q70EK8 1073 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCAF4Q8WV16 495 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNH6Q9H252 994 aa5.11□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 MATN4O95460 622 aa5.1□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAPNS1P04632 268 aa5.1□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 FIGNQ5HY92 759 aa5.1□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.1□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.09□□□□□ -1.59
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ESRRBO95718 433 aa5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCKBRP32239 447 aa5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR85P60893 370 aa5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCIRG1Q13488 830 aa5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 METTL24Q5JXM2 366 aa5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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CACNA2D1-211ENST00000486539 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACAP1Q15027 740 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR19Q15760 415 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 CALML6Q8TD86 181 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB9Q96C00 473 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPRASP2Q96D09 838 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALG1Q9BT22 464 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.08□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUSD5O60279 629 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 BMP15O95972 392 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 BMPR1AP36894 532 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 BACH2Q9BYV9 841 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.07□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf78A6NCI8 922 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 CGB1A6NKQ9 187 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 AHRRA9YTQ3 701 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGRPO00253 132 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPP3Q13368 585 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDB1Q16531 1140 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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