RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 PNMA5Q96PV4 448 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PADI3Q9ULW8 664 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SPTLC2O15270 562 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 RPS6KA5O75582 802 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ARL2P36404 184 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 NUCB2P80303 420 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 GRB10Q13322 594 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM143Q96AN5 459 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CALML4Q96GE6 196 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC9A7Q96T83 725 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CSRNP2Q9H175 543 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 GINS2Q9Y248 185 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.13■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ZBBXA8MT70 800 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CD52P31358 61 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR153Q6NV75 609 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PADI6Q6TGC4 694 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 OSMRQ99650 979 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.12■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A087WZ62 844 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 E9PMD0 336 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ENPP3O14638 875 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KCNJ6P48051 423 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PAK2Q13177 524 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KCNK18Q7Z418 384 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 NLRP7Q8WX94 980 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CLIC6Q96NY7 704 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.11■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM228AQ86W67 206 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KSR1Q8IVT5 923 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 EPSTI1Q96J88 318 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SIP14410 1827 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ARID2Q68CP9 1835 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.1■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CUTAO60888 179 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 AMHP03971 560 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TFDP1Q14186 410 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TOP1MTQ969P6 601 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TIPINQ9BVW5 301 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KCND2Q9NZV8 630 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 LAMA3Q16787 3333 aa20.09■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 GLRA2P23416 452 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC12A3P55017 1021 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PTENP60484 403 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SPECC1Q5M775 1068 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 USP49Q70CQ1 688 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 RNF149Q8NC42 400 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KIFAP3Q92845 792 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SCLT1Q96NL6 688 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TMX1Q9H3N1 280 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CHST12Q9NRB3 414 aa20.08■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms