RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CAMK1Q14012 370 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD1Q15327 319 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 RNF169Q8NCN4 708 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 WASF1Q92558 559 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 TLE6Q9H808 572 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DACT1Q9NYF0 836 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 M0R2N6 131 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.222e-13■■□□□ 12.1
ACTB-212ENST00000484841 NRIP1P48552 1158 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 SCRN1Q12765 414 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ADAM15Q13444 863 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DSC3Q14574 896 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 TLR9Q9NR96 1032 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 STK36Q9NRP7 1315 aa22.64■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 FSD2A1L4K1 749 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 LINC01565O15544 149 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 MBTPS2O43462 519 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 GPR37L1O60883 481 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 FGF18O76093 207 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 IRS1P35568 1242 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PSMC5P62195 406 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 NEK8Q86SG6 692 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 TBX10O75333 385 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ZP2Q05996 745 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 LRRC43Q8N309 656 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 EFHBQ8N7U6 833 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 FAM20AQ96MK3 541 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 MBOAT7Q96N66 472 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 MYO7AQ13402 2215 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PFKFB2O60825 505 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ANAPC15P60006 121 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 KRT17Q04695 432 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 DCXO43602 365 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 EOMESO95936 686 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 FGFR4P22455 802 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PPM1AP35813 382 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 NPY5RQ15761 445 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 FAM122AQ96E09 287 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ZNF558Q96NG5 402 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 CWH43Q9H720 699 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 CHST12Q9NRB3 414 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 A0A0U1RQF3 1178 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SLC37A4O43826 429 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SKIP12755 728 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ZNF410Q86VK4 478 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 CASD1Q96PB1 797 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 HCSTQ9UBK5 93 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 LZTS1Q9Y250 596 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WZ62 844 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-212ENST00000484841 TMEM150BA6NC51 233 aa22.59■■□□□ 1.21
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