RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482814.5

GCOM1-208, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 2

Gene GCOM1, Length 1,620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-208ENST00000482814 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.33■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.33■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SYCE3A1L190 88 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PLS3P13797 630 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ABCD1P33897 745 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ARL2P36404 184 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 EHHADHQ08426 723 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 COASYQ13057 564 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MAPK7Q13164 816 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MYCT1Q8N699 235 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 IFT74Q96LB3 600 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ARID2Q68CP9 1835 aa20.32■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 CCDC192P0DO97 292 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PPP1R2P41236 205 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SMTNP53814 917 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MORC3Q14149 939 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 DAW1Q8N136 415 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 METTL13Q8N6R0 699 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 H0YCG3 227 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ODR4Q5SWX8 454 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MAP7D2Q96T17 732 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ANO10Q9NW15 660 aa20.31■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 KIF20AO95235 890 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 RSPH10BP0C881 870 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 NLRP12P59046 1061 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ZNF445P59923 1031 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 POU5F1BQ06416 359 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 NME8Q8N427 588 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 TMEM143Q96AN5 459 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 DACH1Q9UI36 760 aa20.3■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 GRIN2DO15399 1336 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ARVCFO00192 962 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 CYP2C9P11712 490 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 NAMPTP43490 491 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ALCAMQ13740 583 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 TFDP1Q14186 410 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 STX1AQ16623 288 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SFR1Q86XK3 245 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MLKLQ8NB16 471 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.29■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 SFI1A8K8P3 1242 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 BIN1O00499 593 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 CAVIN2O95810 425 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 TYRO3Q06418 890 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 KCNN1Q92952 543 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.28■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 TREHO43280 583 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 CLCN3P51790 818 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PEX3P56589 373 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 STIM1Q13586 685 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 RPAINQ86UA6 219 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 RSPH3Q86UC2 560 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 KAT6AQ92794 2004 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.27■□□□□ 0.84
GCOM1-208ENST00000482814 GLRA2P23416 452 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 NPTX2P47972 431 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 CDK7P50613 346 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 NCKAP1LP55160 1127 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 HIC1Q14526 733 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 PTGISQ16647 500 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.27■□□□□ 0.83
GCOM1-208ENST00000482814 SERINC5Q86VE9 423 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms