RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC16A6	O15403	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	F13B	P05160	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CEACAM5	P06731	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	TNFSF4	P23510	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MAPK10	P53779	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	RASSF7	Q02833	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	TAF12	Q16514	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PHKB	Q93100	1093 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996		X6R8D5	127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	C22orf46	C9J442	243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	FRS3	O43559	492 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	COL6A2	P12110	1019 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	FPR2	P25090	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PRIM2	P49643	509 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	EGR3	Q06889	387 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	STARD3	Q14849	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CT83	Q5H943	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	DLG3	Q92796	817 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	NACAD	O15069	1562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KDM4C-208	ENST00000480996	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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