RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475553.1

USP37-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 37, human

TSL 4

Gene USP37, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP37-208	ENST00000475553	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	MTG2	Q9H4K7	406 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	USP18	Q9UMW8	372 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	MYPN	Q86TC9	1320 aa		7.41	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	PRSS38	A1L453	326 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	GABRD	O14764	452 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	KNG1	P01042	644 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	MOGS	Q13724	837 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	ACAP2	Q15057	778 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	STIL	Q15468	1287 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	DGKD	Q16760	1214 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	CMIP	Q8IY22	773 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	EDAR	Q9UNE0	448 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	CFTR	P13569	1480 aa		7.4	□□□□□ -1.22
USP37-208	ENST00000475553	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553		A0A0G2JNJ9	132 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	KRT1	P04264	644 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	NEK2	P51955	445 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CAP1	Q01518	475 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	RTP5	Q14D33	572 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	KANK2	Q63ZY3	851 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	JDP2	Q8WYK2	163 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553		Q9UFV3	132 aa		7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	KLHL33	A6NCF5	533 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	NRP2	O60462	931 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CUTA	O60888	179 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	LPL	P06858	475 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	ZNF28	P17035	718 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	POLD1	P28340	1107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	KCNQ1	P51787	676 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	PPARA	Q07869	468 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	SPIDR	Q14159	915 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	ZNF124	Q15973	351 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	MCTP2	Q6DN12	878 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	DYDC2	Q96IM9	177 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	WIZ	O95785	1651 aa		7.38	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	SH3D21	A4FU49	640 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	OPHN1	O60890	802 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	HMGCR	P04035	888 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	GPR3	P46089	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	MEOX1	P50221	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	EPHB1	P54762	984 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	LGALS4	P56470	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	NRG3	P56975	720 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	PRR31	Q5SQ13	230 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CARF	Q8N187	725 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	GAB3	Q8WWW8	586 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	TOX2	Q96NM4	488 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		7.37	□□□□□ -1.23
USP37-208	ENST00000475553	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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