RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475335.5

SIKE1-208, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-208ENST00000475335 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 VCANP13611 3396 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 MED24O75448 989 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 DGKIO75912 1065 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 TECP42680 631 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 RGS18Q9NS28 235 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 C9IYK1 514 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 GRB10Q13322 594 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 EMC2Q15006 297 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 XKR9Q5GH70 373 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 ODR4Q5SWX8 454 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 KSR1Q8IVT5 923 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 NLRP7Q8WX94 980 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 ADAM2Q99965 735 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 A0A087WZ62 844 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 FGFR4P22455 802 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 RARRES1P49788 294 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 DNM2P50570 870 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 FAM189BP81408 668 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 PTGDRQ13258 359 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 MCTP1Q6DN14 999 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF410Q86VK4 478 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM143Q96AN5 459 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 A0A087WWV3 80 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 H3BQV1 296 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 IGFBP4P22692 258 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 CDC42EP1Q00587 391 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 IL17AQ16552 155 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-208ENST00000475335 DENND3A2RUS2 1198 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 RPA1P27694 616 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 GATMP50440 423 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 SCLT1Q96NL6 688 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PRPHP41219 470 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ECM1Q16610 540 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 EPC2Q52LR7 807 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 POTEGQ6S5H5 508 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 NLRP4Q96MN2 994 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 SAMD11Q96NU1 681 aa23.44■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 LAD1O00515 517 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 STAG3L1P0CL83 205 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 FERMT3Q86UX7 667 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM192Q8IY95 271 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 FIBCD1Q8N539 461 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 MTRQ99707 1265 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 RNF19AQ9NV58 838 aa23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 DGAT1O75907 488 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 PDIA5Q14554 519 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ERMNQ8TAM6 284 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 TCP11Q8WWU5 503 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 SNX21Q969T3 373 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SIKE1-208ENST00000475335 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.42■■□□□ 1.34
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