RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.54□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 AGBL4Q5VU57 503 aa9.54□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.54□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.54□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.54□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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SGCE-210ENST00000472326 EYA4O95677 639 aa9.53□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 EPHB4P54760 987 aa9.53□□□□□ -0.88
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SGCE-210ENST00000472326 ANO3Q9BYT9 981 aa9.53□□□□□ -0.88
SGCE-210ENST00000472326 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.53□□□□□ -0.88
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SGCE-210ENST00000472326 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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SGCE-210ENST00000472326 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.52□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 DYDC2Q96IM9 177 aa9.52□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 BRINP1O60477 761 aa9.51□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 GNRHR2Q96P88 292 aa9.51□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 RAC3P60763 192 aa9.5□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 CELA3BP08861 270 aa9.49□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 ACAP1Q15027 740 aa9.49□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.48□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.47□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 NFYCQ13952 458 aa9.47□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
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SGCE-210ENST00000472326 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SGCE-210ENST00000472326 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 C2orf78A6NCI8 922 aa9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 K7ESM1 405 aa9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 GPR39O43194 453 aa9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 PFKMP08237 780 aa9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 HGFACQ04756 655 aa9.46□□□□□ -0.9
SGCE-210ENST00000472326 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.46□□□□□ -0.9
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