RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ANO5Q75V66 913 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 POTEDQ86YR6 584 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 C4orf19Q8IY42 314 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 CYP26B1Q9NR63 512 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TMEM150BA6NC51 233 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 FAM205CA6NFA0 338 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 GRM6O15303 877 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 HOXA2O43364 376 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 C8orf34Q49A92 452 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ZNF410Q86VK4 478 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SLC7A3Q8WY07 619 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 AAASQ9NRG9 546 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PLAGL2Q9UPG8 496 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 RFC5P40937 340 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SPIRE1Q08AE8 756 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ST3GAL1Q11201 340 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 DRP2Q13474 957 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 CALCRLQ16602 461 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TCEAL5Q5H9L2 206 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 NCAPH2Q6IBW4 605 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 CCDC83Q8IWF9 413 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 CEP170P1Q96L14 293 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 CHST12Q9NRB3 414 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 DACT1Q9NYF0 836 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TBKBP1A7MCY6 615 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 GAS2O43903 313 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 NEMFO60524 1076 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 YWHABP31946 246 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 GATMP50440 423 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 FAM102BQ5T8I3 360 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 NEK9Q8TD19 979 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 LXNQ9BS40 222 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 A0A087WZ62 844 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 A0A0U1RQF3 1178 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 EOMESO95936 686 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 KCNA5P22460 613 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 FOSBP53539 338 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 NPEPPSP55786 919 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 COL19A1Q14993 1142 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ECHDC2Q86YB7 292 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ABI1Q8IZP0 508 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 KLHL23Q8NBE8 558 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SPPL3Q8TCT6 385 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TCP11Q8WWU5 503 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 DYDC2Q96IM9 177 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 C8orf76Q96K31 380 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 KIF2CQ99661 725 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TMEM117Q9H0C3 514 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 RGL1Q9NZL6 768 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ITGB1P05556 798 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 FGFR1P11362 822 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 SKIP12755 728 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 UBE3AQ05086 875 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TPH2Q8IWU9 490 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 RSPH1Q8WYR4 309 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 MTMR9Q96QG7 549 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TRAIPQ9BWF2 469 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-205ENST00000467594 ASAP2O43150 1006 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 SLITRK3O94933 977 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 LYPLA2O95372 231 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 LAG3P18627 525 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 FGFR4P22455 802 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 TXKP42681 527 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 GUCY1B3Q02153 619 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 CYP4A11Q02928 519 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-205ENST00000467594 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms